九州新幹線西九州ルート（長崎ルート）は、博多～長崎間を結ぶ約143kmのルートです。
このうち、博多～新鳥栖間は鹿児島ルートを共用し、新鳥栖～武雄温泉間は現在の長崎本線、佐世保線をそのまま利用し、武雄温泉～長崎間に新幹線鉄道規格の新線を建設するものです。
博多～新鳥栖間及び武雄温泉～長崎間（線路幅：1,435mm）と新鳥栖～武雄温泉間（線路幅：1,067mm）では線路幅が違いますので、車輪の幅を変換できるフリーゲージトレインを導入することを前提として、武雄温泉～長崎間の新線整備に着手したものです。
しかしながら、フリーゲージトレインの開発の遅れから、平成28年度に、国が、令和4年度（平成34年度）に武雄温泉駅での対面乗換方式（リレー方式）により開業することを提案され、佐世保線江北（肥前山口）～武雄温泉間の全線複線化を進めつつ令和4年度にリレー方式で開業することが、関係六者で合意されています。
その後、令和4年9月23日の西九州新幹線の開業により、鉄道がなかった嬉野市に嬉野温泉駅が新設され、武雄温泉駅では新幹線及び在来線の全ての列車が停車しています。一方、長崎本線肥前鹿島駅の特急列車が大幅に減り、江北（肥前山口）～諫早間は上下分離方式（※）により運行されています。
※上下分離方式：JR九州が列車を運行し、佐賀・長崎両県が鉄道施設を管理する方式